| グ ラ ム 陰 性 通 性 嫌 気 性 桿 菌 | 腸内細菌科 | 大腸菌 | 腸管内常在菌．異所性感染．下痢を主症状とする腸管感染症の他，尿路感染症，新生児髄膜炎など |
| 赤痢菌（シゲラ属菌） | 病原性：細胞内侵入性，志賀毒素．２類感染症．下腹部痛，発熱，下痢，しぶり腹など | ||
| サルモネラ属菌 | 腸管に生息．サルモネラ症（食中毒型で，発熱，頭痛など），チフス症（敗血症型） | ||
| エルシニア属菌 （主にペスト菌） | 皮膚ペスト，腺ペスト（リンパ節腫大）→肺ペスト（敗血症，出血性気管支肺炎） | ||
| クレブシェラ属菌 | 腸内･口腔内･上気道の常在菌．肺炎，気管支炎，敗血症，化膿性骨髄炎など | ||
| セラチア属菌 | 日和見感染菌群の１つ．創傷感染，肺炎，肺化膿症など | ||
| ビブリオ科 | コレラ菌 | 経口摂取→小腸で定着･増殖→コレラ毒素を産生→水様性下痢．２類感染症 | |
| 腸炎ビブリオ | 海水･汽水域に生息．日本で頻度が高い（海産魚介類生食嗜好性による）．下痢，腹痛，嘔吐など | ||
| グラム陰性 好気性桿菌 | 百日咳菌 | 急性気道感染症の百日咳の原因菌．発作性咳嗽･呼気性の喘鳴が特徴．3種混合ワクチン | |
| レジオネラ属菌 | 水，土壌など自然界に広く分布．細胞内増殖性（貪食細胞の中で増殖可能）．ポンティアック熱，肺炎 | ||
| ス ピ ロ ヘ ｜ タ | スピロヘータ科 | トレポネーマ属 | らせん状．偏性嫌気性or微好気性．梅毒トレポネーマ，熱帯菌種トレポネーマなどの種類がある |
| ボレリア属 | らせん状．シラミやダニによって媒介．回帰熱ボレリア，ライム病ボレリアなどの種類がある | ||
| レプトスピラ科 | ワイル病の病原体．ラットが自然宿主．偏性好気性 | ||
| グ ラ ム 陽 性 球 菌 | ブドウ球菌 | 黄色ブドウ球菌 | 常在菌．院内感染症の原因菌．創傷・転移性・毒素性の感染症や食中毒．MRSA（メチシリン耐性） |
| コアグラーゼ陰性 ブドウ球菌 | 典型的な常在菌．激しい作用を発揮する毒素は作らない．医原性疾患 | ||
| レンサ球菌 | Ａ群レンサ球菌 | 咽頭熱や猩紅熱，トキシン･ショック様症候群，その他，続発症として急性糸球体腎炎，リウマチ熱 | |
| Ｂ群レンサ球菌 | 直腸･膣の常在菌．新生児期･産褥期の児に感染．敗血症，肺炎，髄膜炎など | ||
| 肺炎レンサ球菌 | 市中感染による肺炎の重要な原因菌．肺炎の他，心内膜炎，関節炎，腹膜炎，軟部組織の炎症など | ||
| 緑色レンサ球菌 | 口腔内･上気道の常在菌．亜急性心内膜炎 | ||
| Ｄ群レンサ球菌 | 敗血症，心内膜炎 | ||
| 腸球菌 | 腸管系の常在菌．市中感染とともに院内感染の病原体として重要．尿路感染症，敗血症，心内膜炎 | ||
| 嫌 気 性 有 芽 胞 菌 | クロスト リジウム属 | 破傷風菌 | 世界中に広く分布．創傷より感染．破傷風毒素（神経毒）．DPTワクチン．痙攣発作，弓そり緊張 |
| ボツリヌス菌 | 世界的に広く分布．食事性ボツリヌス中毒，乳児ボツリヌス．ボツリヌス毒素．“いずし” | ||
| ウェルシュ菌 | ガスを伴う急激な筋肉の壊死を主とした病変（ガス壊疽）と食中毒 | ||
| ディフィシル菌 | 下痢，腹痛．多くの抗生物質に対し耐性 | ||
| 放 線 菌 | マイコ バクテリウム （抗酸菌） | 結核菌 | ほぼ100％吸入感染による．ツベルクリン反応．予防ワクチン：BCG |
| 非結核性抗酸菌 | Ⅰ～Ⅳ群に分類される | ||
| らい菌 | ハンセン病の原因菌．らい腫型･類結核型，境界群･未分化群に分類される | ||
| ｺﾘﾈﾊﾞｸﾃﾘｳﾑ属 | ジフテリア菌 | 好気性or通性嫌気性．ジフテリア毒素．2類感染症．3種混合ワクチン | |
| リケッチャ | リケッチャ属 | 生きた細胞の中でのみ増殖．ノミ･シラミ･ダニのいずれか（ベクターとよぶ）による媒介．発疹チフス | |
| オリエンチア属 | ツツガムシ病 | ||
| エールリキア属 | 腺熱リケッチャ症 | ||
| クラミジア | 節足動物の媒介必要なし．エネルギー寄生体．特異な増殖環．オウム病，トリ病 | ||
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